北京電子科技學院計算機科學與技術系的前身是八十年代設立的第五教研室(計算機教研室)，1988 年9月成立計算機科學與技術系，93年開始第一屆本科生招生，是我院最早招生本科生的系之一。

全系現有專兼職教職工33人，教授3人，副教授(含高級實驗師)13人，與西電合作計算機體系結構和密碼學碩士研究生導師5人，院學術學科帶頭人6人。具有博士學位的教師4人(含博士后2人)。

系設有計算機基礎教研室、計算機硬件教研室、計算機軟件教研室、計算機應用教研室和計算機硬件與應用實驗室及信息技術實驗室(原計算中心)和一個系設研究室。

該系不斷地完善學科與專業(yè)建設，現設立"計算機科學與技術"和"信息安全"兩個專業(yè)方向，課程體系設置堅持基礎理論不動搖、能力培養(yǎng)為根本、突出創(chuàng)新能力培養(yǎng)、合理取舍教學內容，遵循高教規(guī)律的原則。"計算機科學與技術"專業(yè)方向的課程體系具有軟硬件互相滲透和通信的行業(yè)特色;"信息安全"專業(yè)方向的課程體系以公共安全和實用密碼理論與技術為對象。主要特色課程有：多媒體技術及加密、數據庫原理設計及加密、數字圖像處理及加密、嵌入式系統(tǒng)、Internet安全協議及應用、積極防御理論及應用、網絡對抗技術、信息安全數學基礎等。